|
|
Identifikace efektorů sekrečního systému typu III u bakterií rodu Aeromonas
Jirsová, Anežka ; Kamanová, Jana (vedoucí práce) ; Lišková, Petra (oponent)
Bakterie rodu Aeromonas jsou gramnegativní tyčinkovité bakterie, které jsou všudypřítomné ve vodním prostředí. Mezofilní druhy tohoto rodu, reprezentované A. hydrophila, A. dhakensis, A. veronii a A. schubertii, jsou nejen důležitými patogeny u ryb, ale jsou patogenní rovněž u lidí. Jsou původci gastrointestinálních a systémových infekcí a infikují rovněž rány. Jejich virulence byla popsána jako multifaktoriální a spojená s přítomností sekrečního systému typu 3. O efektorových proteinech, které jsou tímto systémem dopravovány do hostitelské buňky, však není mnoho známo. Cílem této práce bylo charakterizovat dva různé sekreční systémy typu 3, a to API-1 a API-2 u A. schubertii s ohledem na jejich buněčnou cytotoxicitu a identifikovat efektorové proteiny, které transportují do hostitelské buňky. K dosažení těchto cílů byla použita řada metod, včetně mikrobiologických technik, molekulárního klonování, práce s tkáňovou kulturou, elektroforézy na SDS polyakrylamidovém gelu a hmotnostní spektrometrie. Úspěšná konstrukce mutantních kmenů A. schubertii s inaktivovanými systémy API-1 nebo API-2 a kmene s delecí genu kódujícího negativní regulátor API-1 mi umožnila identifikovat potenciální efektorové proteiny typu 3 tohoto druhu. Mezi identifikovanými proteiny byly homology známých efektorových proteinů...
|
|
|
Role proteinu BopN v sekrečním aparátu typu III u bakterií rodu Bordetellae
Kincová, Veronika ; Kamanová, Jana (vedoucí práce) ; Večerek, Branislav (oponent)
Bakterie rodu Bordetella jsou původci vysoce nakažlivého černého kašle u lidí (B. pertussis, B. parapertussis) nebo respiračních onemocnění u ostatních savců (B. bronchiseptica, B. parapertussis). Jedním z faktorů virulence rodu Bordetella je i sekreční systém typu 3 (T3SS), který slouží k dopravě efektorových proteinů přímo z cytozolu bakterie do cytozolu eukaryotické buňky. Protein BopN je substrátovým proteinem T3SS, jemuž je přisuzována efektorová funkce. Nicméně proteiny homologní proteinu BopN u jiných bakterií zprostředkovávají regulaci hierarchické sekrece skrze T3SS a některé z nich jsou zodpovědné i za inhibici sekrece skrze T3SS v prostředí s 2 mM Ca2+, např. v tělních tekutinách hostitele, pokud ještě nedošlo ke kontaktu bakterie s cílovou buňkou. Tato práce se zabývá funkcí proteinu BopN a rovněž rolí vápenatých iontů v aktivitě T3SS u B. bronchiseptica. Aktivita T3SS v médiu bez vápníku a po přídavku 2 mM vápníku byla stanovena 2 nezávislými metodami. Bylo zjištěno, že 2 mM přídavek vápníku vede ke snížení sekrece T3SS reportéru do média a tato regulace je závislá na přítomnosti proteinu BopN. Podobný vliv vápenatých iontů na sekreci skrze T3SS byl pozorován i pomocí hmotnostní spektrometrie. BopN protein reguloval mobilizaci a sekreci translokátorového proteinu T3SS, BopD. Role...
|
host ::
RSS.